ورود سامانه مودیان منجر به ایجاد تغییرات قابل توجهی در سرفصل وظائف و امور روزانه حسابداران خواهد شد. با حذف فرآیند صدور فاکتورهای خرید و فروش فیزیکی ، عدم لزوم ارسال اظهارنامه مالیات بر ارزش افزوده و کنسل شدن تهیه و ارسال صورت معاملات فصلی ، سردرگمی عجیبی در خصوص نقش حسابداران در امور مالیاتی مطرح می شود.
در این زمان حسابدارانی که با درک درست و کاملِ نقش سامانه مودیان در کشور ، شروع به یادگیری و کسب مهارت های کار با پنل سامانه مودیان می نمایند ؛ فرصت تحکیم جایگاه خود در کسب و کار را به دست خواهند آورد.